在知网上查重参考文献有多种方法。一种常用的方式是将您的参考文献逐一粘贴到知网的查重平台中，系统会自动检测文献的原创性和重复率。另外，您也可以将整篇论文上传至知网查重系统，系统会自动为您检测文献中的重复内容。

除了直接在知网上查重外，还可以使用一些第三方的查重工具。这些工具通常具有更加灵活的设置选项，可以根据您的需求进行定制化查重。不过，在使用第三方工具时，一定要选择正规可靠的平台，以确保查重结果的准确性和可靠性。